Nach der Seligsprechung von Schwester Teresa Benedicta vom Kreuz, Edith Stein, am 1. Mai 1987 in Köln durch Papst Johannes Paul II., nahm in der St.-Michaelis-Kirche in Breslau (Wrocław) die Verehrung der Seligen zu. Während ihrer Aufenthalte in Breslau (Wrocław) betete Edith Stein im rechten Kirchenschiff der Kirche in der dritten Bank. Die Tatsache, dass ihr Elternhaus in der Nähe St.-Michaelis-Kirche liegt, weckte das Interesse der Gemeindemitglieder an Edith Stein.
Der Hauptverfechter der Verehrung der seligen Teresa Benedicta vom Kreuz in der St.-Michaelis-Kirche war der damalige Pfarrer Jerzy Witek. Er begann zahlreiche Initiativen, wie die Einführung einer Messe am neunten Tag eines jeden Monats zum Gedenken an das Martyrium von Edith Stein in Auschwitz-Birkenau (9. August 1942). Er gab ein Gemäldes der Seligen Teresa Benedicta vom Kreuz in Auftrag (das Gemälde wurde von Jolanta Kornecka gemalt. Einige Monate nach der Weihe des Bildes trat diese in den Karmeliterorden ein). Außerdem die Eröffnung einer Kapelle zu Ehren der Seligen, die Herausgabe einer Gedenkpostkarte mit einem Bild der Kapelle und schließlich die Pflege von Kontakten mit Menschen aus aller Welt, die sich für die Person Edith Stein interessieren.
Zu dieser Zeit kam Sławomir Kowalewski, ein für Edith Stein begeisterter Historiker, aus Warschau nach Breslau (Wrocław). Er nahm Kontakt zu Pfarrer Jerzy Witek auf, woraufhin am 19. September 1989 ein Organisationstreffen stattfand, bei welchem der Verein der Seligen Edith Stein gegründet, ihre Statuten bestätigt und der Gründungsausschuss gewählt wurde. Dem Gründungsausschuss gehören folgende Mitglieder an: Ernest Niemczyk, Danuta Skraba (Gemeindemitglieder der St.-Michaelis-Kirche) und Halina Adamska-Mil (Cousine der Karmeliterin Schwester Immakulaty Adamskiej, einer Expertin für das Leben und Werk von Edith Stein). Es wurde vereinbart, dass der Ausschuss in der St.-Michaelis-Kirche arbeiten würde. Das Treffen fand im Gemeindehaus statt. Zuvor feierte Pfarrer Jerzy Witek die Heilige Messe.
Nachdem das Gründungskomitee die Eintragung des Vereins beim Landgericht in Breslau (Wrocław) beantragt hatte, wurde Pfarrer Jerzy Witek von einer Gruppe junger Leute von der Universität Breslau (Wrocław) unter der Leitung von Rafała Dutkiewicza und Wojciecha Hanna (dem späteren ersten Vorstand der Edith-Stein-Gesellschaft) angesprochen. Bei ihrem eigenen Versuch, einen ähnlichen Verein einzutragen, waren sie mit den Tätigkeiten der St.-Michaelis-Kirche bekannt geworden. Gemeinsame Gespräche führten zur Aussetzung des Eintragungsverfahrens und zum Zusammenschluss der beiden Gruppen, zu einer Änderung der Satzung und des Namens der Gesellschaft sowie zur Einberufung einer zweiten Organisationssitzung am 10. Dezember 1989. Diesem Treffen ging eine Heilige Messe in der Kirche voraus, die von Bischof Tadeusza Rybaka zelebriert wurde. Dieser weihte auch ein Gemälde mit dem Bild der seligen Teresa Benedicta vom Kreuz. Dieses Treffen fand im Haus der Familie Edith Stein in der ul. Nowowiejska 38 unter der Leitung von Ernest Niemczyk statt und endete mit einer Bestätigung der vorgeschlagenen Satzungsänderungen und der Annahme des neuen Namens „Edith-Stein-Gesellschaft“. Diese Neuerungen wurden dem Woiwodschaftsgericht in Breslau (Wrocław), zusammen mit einer Liste der Teilnehmer des Treffens, als ergänzende Unterlagen zum früheren Antrag vorgelegt. Am 19. Dezember 1989 wurde die Edith-Stein-Gesellschaft durch eine Entscheidung des Landgerichts Breslau (Aktenzeichen: I Ns Rej. Dt. 19/89) eingetragen.
Kurz nach der Eintragung der Gesellschaft bemühte sich das Gründungskomitee um den Erwerb des Elternhauses von Edith Stein in der ul. Nowowiejska 38 in Breslau (Wrocław), und ebenfalls auf dessen Initiative wurde einer der Räume des Collegium Anthropologicum der Universität Breslau (Wrocław) nach Edith Stein benannt (in diesem Raum befindet sich die Fotografie eines Porträts von Edith Stein aus der Zeit ihres Studiums in Breslau, gemalt von dem zeitgenössischen Maler Michała Bieganowskiego). Das Gründungskomitee mit Pfarrer Jerzy Witek, Slawomir Kowalewski, Michal Bieganowski, Wojciech Hann, Monika Zmudzinska und Barbara Kwiatkowska organisierte die erste Generalversammlung der Gründungsmitglieder der Edith-Stein-Gesellschaft. Die für diese Generalversammlung erstellte Liste der Gründungsmitglieder der Edith-Stein-Gesellschaft umfasste die Mitglieder der Organisationstreffen vom 19. September 1989 und 10. Dezember 1989. Archivfotos aus der ersten Organisationsphase sowie Einladungen zur Generalversammlung wurden von Michała Bieganowskiego aufgenommen.